Depuis la fin de la décennie 1970, la littérature sur les coûts cachés développe l'idée selon laquelle un virus invisible affecte négativement les organisations (Savall, 1975, Savall & Zardet, 1987, 2008). La dégénérescence du système éducatif camerounais problématise les conséquences d'un tel virus. L'objectif de cette communication est d'analyser l'impact des coûts cachés sur la performance scolaire des apprenants. A partir d'une analyse quantitative des données collectées auprès de 175 élèves des établissements secondaire d'enseignement technique au Cameroun, il est question dans cette étude de montrer le degré d'impact qu'ont ces coûts sur la performance scolaire. Dans une approche de recherche positiviste, nous avons par la suite testé nos hypothèses, en exploitant la modélisation des équations structurelles à travers le logiciel SmartPLS version3.7. Les résultats montrent que c'est l'aspect professionnel de la performance scolaire qui est le plus affecté négativement par l'absentéisme et la rotation du personnel. L'impact des coûts cachés sur l'aspect académique de la performance scolaire n'étant pas aussi significatif que l'aspect professionnel bien qu'étant négatif.